Miten pysyä ajan tasalla tieteestä: PubMedin ja Google Scholarin hakuvahdit

1. Johdanto

Aikaisemmin minulla oli tapana hakea tietoa tieteellisistä aiheista lähinnä menemällä nettiselaimella tieteellisten hakukoneiden sivuille (PubMed tai Google Scholar) ja etsimällä mielenkiinnon mukaan haluamistani asioista tietoa.

Nykyisin ensisijainen tiedonhakustrategiani on hieman erilainen. En enää hae tietoa kovin usein manuaalisesti, vaan saan sähköpostiini jatkuvasti hakukoneiden lähettämiä ilmoituksia uusista tutkimusartikkeleita itse valitsemieni hakusanojen pohjalta.

Lääketieteen tutkimuskirjallisuuteen erikoistuneella PubMed-hakupalvelussa ilmoituspalvelun nimi on Saved Searches. Googlen Scholar -palvelussa ilmoituspalvelusta käytetään nimeä Alerts.

• PubMedin ilmoituspalvelussa voi valita, tulevatko sähköposti-ilmoitukset päivittäin, viikottain vai kuukausittain. Yhdessä ilmoituksessa listataan enintään 200 uutta artikkelia.
• Google Scholarin ilmoituspalvelussa kaikki ilmoitukset tulevat yhtenä ryppäänä noin kahdesti viikossa. Yhdessä ilmoituksessa listataan enintään 20 uutta artikkelia.

Tässä on esittelyn nimissä muutama kuvakaappaus näistä kyseisistä palveluista:

Google Scholar -ilmoituksia

Google Scholar -ilmoituksen sisältöä

PubMedin sähköposti-ilmoituksia

PubMed-ilmoituksen sisältöä

Alla kerron lyhyesti omasta tavasta käyttää näitä palveluita.



2. Tiedelehtien seuraaminen

PubMedin hakuvahti toimii mainiosti tiedelehtien seurantaan, sillä [jour] -hakuoperaattorilla haun voi rajata haluttuun tiedelehteen. Lisäksi rajaamalla haun pelkästään tiivistelmän sisältäviin artikkeleihin (Text availability: Abstract) pääsee kätevästi eroon turhista kirjeistä/kommentaareista, joita varsinkin huippulehdet julkaisevat huomattavan paljon.

Omalta lukulistaltani löytyy lääketieteen kovimmat lehdet (NEJM, JAMA, Lancet, Nature) kuten myös muita kohtuullisen hyvätasoisia erikoisalojen lehtiä (aineenvaihdunta, ravitsemus, diabetes). Lisäksi seuraan katsauslehtiä, sillä esimerkiksi Physiology Reviews julkaisee tunnetusti erittäin laajoja ja mielenkiintoisia katsauksia erinäisiin aiheisiin liittyen.

Mikäli et tunne tiedelehtiä nimeltä, eri tieteenalojen tiedelehtien top-listoja on julkaistu muun muassa Scimago Journal Rankings -sivustolla.

Seuraamiani tiedelehtiä (PubMed Saved Searches)
Huippulehdet #1 N Engl J Med Nature Nat Med Science	Huippulehdet #2 Proc Natl Acad Sci Sci Transl Med BMJ J Clin Invest Ann Intern Med PLOS Med	Huippulehdet #3 Am J Med Br J Sports Med J Clin Oncol Neuron Elife Cancer Cell	Huippulehdet #4 Am J Respir Crit Care Med Biol Psychiatry Acta Neuropathol World Psychiatry Intensive Care Med J Exp Med
Katsauslehdet Nature Reviews -lehdet Annual Reviews -lehdet Physiology Reviews Trends Cell Biol Trends Mol Med Trends Endocrinol Metab Trends Neurosci Ageing Res Rev	JAMA-lehdet JAMA JAMA Netw Open JAMA Intern Med JAMA Psychiatry JAMA Ophthalmol JAMA Pediatr JAMA Cardiol JAMA Oncol JAMA Surg (...)	Lancet-lehdet Lancet Lancet Gastroenterol Hepatol Lancet Diabetes Endocrinol Lancet Global Health Lancet Respir Med Lancet Infect Dis Lancet Psychiatry Lancet Neurol Lancet Oncol (...)	Nature-lehtiä Nat Commun Nat Neurosci Nat Biotechnol Nat Biomed Eng Nat Cell Biol Nat Genet
Sisätaudit Gastroenterology Hepatology Circulation Circ Res Eur J Heart Fail J Am Coll Cardiol Diabetes Care Gut (...)	Ravitsemustiede Am J Clin Nutr Clin Nutr Br J Nutr Adv Nutr Nutrients J Nutr Amino Acids Eur J Nutr (...)	Solubiologia Cell Cell Rep Mol Cell EMBO J EMBO Rep Mol Ther EBioMedicine Mol Neurodegener (...)	Metabolia & Redox Free Radic Biol Med Antioxid Redox Signal Oxid Med Cell Longev Redox Biol Cell Metab Nat Metab
Tutkimusmenetelmät J Clin Epidemiol  BMJ Evid Based Med Am J Epidemiol Clin Trials	Cochrane-katsaukset Cochrane Database Syst Rev	Gerotieteet Geroscience	Hammaslääketiedettä J Dent Res
Valobiologiaa Photobiomodul Photomed Laser Surg J Photochem Photobiol B Photochem Photobiol J Biophotonics Lasers Med Sci Lasers Surg Med		Lihavuustutkimus Int J Obes (Lond) Obesity (Silver Spring) Curr Obes Rep Appetite	Unilääketiede Sleep Med Sleep Med Rev Sleep Sleep Res

Näiden lehtien seuraamisen lisäksi tarkistan kotimaisen Aikakauskirja Duodecimin uudet artikkelit parin viikon välein lehden nettisivulta, sillä hammaslääketieteen opiskelijana en saa kyseistä lehteä postissa.




3. Tutkijoiden seuraaminen

Mikäli haluaa seurata tutkijoiden uusia julkaisuja tai on kiinnostunut uusista tutkimusartikkeleista, joissa siteerataan tiettyjä tutkijoita, silloin Google Scholarin hakupalvelu on ylivoimaisesti parempi kuin PubMedin.

Olen itse valinnut seurantalistalleni paljon lihavuustutkimukseen, energia-aineenvaihduntaan, ravitsemukseen ja metaboliaan keskittyneitä tutkijoita. Seurattuani useimpia näistä tutkijoita nyt jo parin vuoden ajan koen olevani monessakin aiheessa kohtuullisen hyvin "ajan hermoilla".

Seuraamiani tutkijoita (Google Scholar Alerts)
Lihavuus Stephan J Guyenet (lihavuus) Johan Alsiö (lihavuus, nälänsäätely aivoissa) Eliana P Araujo (lihavuus, hypotalamus) Marci Gluck (lihavuus, neuromodulaatio) Martin G Myers (lihavuus, leptiinisignalointi) I Sadaf Farooqi (lihavuus, leptiini) Anthony Sclafani (nälänsäätely) Hans-Rudolf Berthoud (nälänsäätely) Eric Ravussin (tärkeä lihavuustutkija) Matthias Tschöp (lihavuus, farmakologia) Kevin Hall (lihavuus, karppaus) Kirsi Pietiläinen (lihavuus) Anthony P Goldstone (lihavuus, greliini) Michael W Schwartz (lihavuus, hypothalamus, insuliini, aivot) Yvonne M. Ulrich-Lai (stressi, nälkä, lihavuus)	Energia-aineenvaihdunta Johan Auwerx (mitokondriotutkimus) Anu Suomalainen (mitokondriotutkimus) Eija Pirinen (mitokondriotutkimus) Antero Salminen (mitokondrioiden toiminta) Kai Kaarniranta (mitokondrioiden toiminta) Carlos Palmeira (mitokondrioiden toiminta) Michael Ristow (mitohormeesi, ravitsemus) Robert K. Naviaux (mitokondriot, ‘cell danger response’) Quanguang Zhang (mitokondriot, aivosairaudet) Mario D. Cordero (mitokondriot, inflammasomi, fibromyalgia) Gareth G Lavery (NAD+, glukokortikoidit, ym)
Masennus, aivosairaudet, ym. Rudolph E Tanzi (Alzheimerin tauti) Michael Maes (masennus, uupumussairaudet, tulehdus, metabolia) Ronald S Duman (masennus, ketamiini) Eric J Nestler (masennuksen neurobiologia) Andrea Fagiolini (kaksisuuntainen mielialahäiriö) Mohammad Ejaz Ahmed (aivosairaudet, prekliinistä tutkimusta)	Valo & vuorokausirytmi Michael R. Hamblin (punavalohoito) Jonathan Stone (punavalohoito, Parkinsonin tauti) James Carroll (punavalohoito) João Paulo Tardivo (valoherkistinhoito, diabeetikon jalkahaava) Jamie Zeitzer (vuorokausirytmin säätely) Shelley Gorman (D-vitamiini, UV-säteily)
Ravitsemus Valter D. Longo (paasto, kalorirajoitus, ikääntyminen) Luigi Fontana (paasto, kalorirajoitus, ikääntyminen) Yvonne Granfeldt (ravitsemus, paleodieetti, ravintoaineet) Tommy Jönsson (ravitsemus, paleodieetti) Mario Kratz (ravitsemus, elintapasairaudet) Bjørn Liaset (ravintoproteiinit, aminohapot) Rajagopal V. Sekhar (aminohapot, glutationi) Eugene J Fine (karppaus) Dominic D'Agostino (ketoaineet) Kieren Grant Hollingsworth (tyypin 2 diabetes, DiRECT-tutkimus) Victor Zevallos (gluteeni, amylaasi-trypsiini-inhibiittorit)	Metabolia, sydän, ym. Antonio C Bianco (kilpirauhashormonien metabolia) James V. Hennessey (kilpirauhashormonit) Michael P Lisanti (syöpä, mitokondriot) Laurent Schwartz (syöpä, metabolia) Elena Adinolfi (purinerginen signalointi) Inma Castilla-Cortazar (IGF-1) Jan Borén (ateroskleroosi, maksa) Ira Tabas (ateroskleroosi, tulehdus) Kevin Jon Williams (ateroskleroosi, insuliinisignalointi) Susana Ravassa (sydämen vajaatoiminnan mekanismit) Matti Jauhiainen (ANGPTL:t, lipiditutkimus) A. Martin Gerdes (sydämen vajaatoiminta, kilpirauhashormonit) Alessandro Pingitore (sydän, kilpirauhashormonit) Pirkko Pussinen (parodontiitti, LPS, metabolinen terveys)
Psykologia & mindfulness Ami Rokach (yksinäisyys) Mitch Prinstein (ryhmäpsykologia, itsetuhoisuus) Amanda Denes (ihmissuhdepsyka) Mitja Back (narsismi) Clay Routledge (nostalgia) Sara B. Algoe (meditaatio, positiivinen psykologia, tunteet) Judson Brewer (mindfulness, addiktiot) Adrian Wells (metakognitiivinen terapia)	Muita aiheita Robert Zatorre (musiikki, aivot) Paul T. Sharpe (hampaan kantasolut)

4. Aihesanoilla seuraaminen

Tiedelehtien ja tutkijoiden lisäksi seuraan pääosin Google Scholaria käyttäen uusia julkaisuja noin 70 eri aihesanalla. Näiden avulla pysyn hyvin kärryillä, kun tiedemaailmassa ilmestyy uusia havaintoja vaikkapa liittyen ketodieettiin, kilpirauhaseen, moraaliperustoihin tai N-asetyylikysteiiniin.

PubMedin hakuja on halutessaan mahdollista rajata [title] -hakuoperaattorilla siten, että haluttua termiä haetaan vain otsikoista. Esimerkiksi jos hakusanani on randomised [title] OR randomized [title], saan hakutulokseksi vain sellaisia tutkimusartikkeleita, joiden otsikossa esiintyy sana randomised tai randomized.

Seuraamiani hakusanoja   (Google Scholar 90%, PubMed 10%)
A-C Acetazolamide Affective touch AICAR AMPK Blue blocker Butyrate Caries Chronic fatigue Circadian rhythm Cognitive workload CoQ10 Creatine Curcumin Cytochrome oxidase	D-I Deep pressure Dental Double-blind Endodontic Fibromyalgia Food reward Forest bathing Glycine Helium-neon laser Insomnia Interpersonal touch	K-L Ketogenic Light therapy Laser therapy Levothyroxine LLLT Low-carbohydrate Low-fat diet Low-level laser	M Mate preferences Meditation Melatonin Menaquinone Metacognitive therapy Methylene blue Microglia Mindfulness Molecular hydrogen Moral foundations Mortality Motivation	N-R N-acetylcysteine Nicotinamide Overfeeding Periodontal Phlebotomy Phototherapy Photobiomodulation Purinergic signalling P2X7 Photodynamic therapy Pufa Randomised Randomized	S-W Sauna Senolysis Spermidine Social reward Sunlight health Taurine Testosterone Thyroid Thyroid heart Tocotrienol Triiodothyronine Vitamin Weighted blanket Weighted vest

5. Muuta

Yksi keino seurata lääketieteen kiinnostavia tapahtumia on myös uutissivustojen ilmoituspalvelujen käyttö. Minulla itselläni tulee jokaisena arkipäivänä Science X -palvelun uutispoiminnat biologiasta (Phys.org) ja lääketieteestä (Medicalxpress.com).

Medical Xpress -uutiskirje

PubMedissa on lisäksi trending-palvelu, joka näyttää tämän hetken luetuimpia tutkimusartikkeleita.



6. Loppusanat

Julkaisin reilu vuosi sitten blogini Facebook-sivulla videoesittelyn Google Scholarin ilmoituspalvelusta. Kuuden minuutin mittainen video on edelleen ajankohtainen demonstraatio tämän kirjoituksen aiheeseen.

Suosittelen tämänlaisten hakuvahtien käyttöä niin tutkijoille kuin tieteestä kiinnostuneille maallikoillekin. Minusta uusien tieteellisten havaintojen lukeminen on piristävää ja helpottaa tieteellisen sivistyksen kartuttamista, kenties auttaen tutkijoita myös mielekkäiden tieteellisten kysymysten löytämisessä.